去黑痣是否留疤跟黑痣的深浅有关。如果黑痣比较小而且位于真皮的浅层，可以用物理的方法消除病变，比如激光、冷冻，而且愈合以后可能不会留下疤痕。如果黑痣比较大而且位置比较深，累及真皮深层，一般需要采用手术的方法进行消除。手术以后可能会遗留痕迹，但是整形外科缝合的时候是用美容缝合，因考虑到要把瘢痕降到最低，也相对比较隐蔽，而且术后要用抗疤的药物抑制瘢痕的增生，促进瘢痕的愈合。
通常组织愈合是靠瘢痕修复，是否留瘢痕还与个人的体质有很大关系。有些人是瘢痕体质，这类患者术后要进行综合的抗瘢痕治疗，要用一系列抗瘢痕的药物、压迫、放射等方法来抑制疤痕的增生。如果患者手术以后遗留的是正常的生理瘢痕，但患者自己不太满意，可以根据情况进行激光的修复。