长期咳嗽可引起慢性疾病不能得到有效治疗，从而导致不良事件发生。如果长期咳嗽由肺癌引起，肺癌早期症状为干咳、痰中带血，如果长期未发现，无法得到有效治疗。
长期咳嗽可由慢性阻塞性肺疾病引起，慢性阻塞性肺疾病患者有咳嗽、咳痰伴或不伴呼吸困难，部分患者以呼吸困难为主要表现。如果患者长期存在症状，没有得到有效治疗，疾病会进行性发展，出现反复、急性加重情况，导致肺功能进行性下降，使症状逐渐严重。支气管哮喘患者可出现间断地长期咳嗽，说明气道有炎症，如果不控制，会使气道的炎症出现不可逆性改变甚至出现气道重塑 ，导致肺功能下降。