盐酸吗啉胍瓜片的作用与功效主要是抗病毒，是抗病毒药，可以用于治疗如流感病毒、疱疹病毒所引起的感染。从药理作用上看，盐酸吗啉胍能够抑制病毒中的DNA和RNA的聚合酶，从而起到抑制病毒繁殖的作用。
对于DNA病毒，如腺病毒、疱疹病毒，还有对于RNA病毒，如埃可病毒等一系列病毒都有明显的抑制作用。同时药理研究也发现，盐酸吗啉胍对病毒增殖各个周期的各个阶段，都有相应的抑制作用。
但需要注意盐酸吗啉胍片属处方药，必须在医生的指导下，凭医生处方使用，不可以自行在药店购买使用，不可以盲目滥用。用药期间可能出现出汗、食欲不佳，及低血糖等不良反应 ，所以要加强监测。
尤其是平时有低血糖病史的患者，或者患有糖尿病的患者，在用药期间更要关注血糖变化，以免发生危险。此外，和其他药物联合使用时，可能产生不良相互作用，具体要咨询医生或者药师。