头皮囊肿属于良性病变，不切除不会对患者造成过多危害。头皮囊肿会逐渐增长，如果肿物较大，影响患者头部外观、日常生活，如理发时有囊肿，患者可能会觉得别扭，戴帽子时囊肿可能会影响局部外观。如果出现头皮囊肿，可以根据患者自身状态决定是否需要进行手术切除。
头皮囊肿一般位于皮下，进行适当麻醉将囊肿完整切除即可。由于头皮存在较丰富的血液循环，建议患者去大型医院进行手术，让有经验的医生进行临床操作，保证手术安全，术后能得到较好的局部外观。囊肿手术切除以后，需保持伤口周围的清洁、干燥，也可以口 服抗生素预防感染，多数患者不会出现伤口感染。