幽门螺杆菌可以引起口臭，为比较常见的原因。幽门螺杆菌产生尿素酶，在胃窦附近存留，进食食物后，尿素酶分解含氮的营养素，形成氨气，胃气上逆时，可以出现口腔异味，这是最常见的机制。幽门螺杆菌引起的口臭，与消化道症状伴随出现，比如早饱、胃胀、呃逆、反酸、烧心，甚至胃疼等，可以伴随出现，帮助鉴别引起口臭的原因。
口腔的牙齿问题、龋齿或者机会致病菌的滋生，饮食因素，比如吃大蒜等辛香、味道重的食物，均可出现口腔异味。消化系统的问题，比如本身胃气上逆、胃失和降，可以出现腐败气味的上逆，导致口腔异味，特别是平常说话很少的人， 跟人交流少的人，口腔异味更明显。幽门螺杆菌的口腔异味在根除以后，能够得到缓解，这也是帮助判断是否这一个独立因素引起口腔异味的方法。