相对于不怀孕时，孕期妇女免疫力会降低。怀孕是免疫抑制的结果，胚胎有一半的基因来自于异体，即父亲基因，一半基因来自于母体，受精卵包含两部分基因。受精卵细胞从细胞分化成人体，种植在母体子宫里，必须要求母体免疫力降下来，即母体排斥异体细胞能力降下来，胚胎才能存活，所以孕期免疫力一定降低。
孕期有各种不适，从早孕反应、中孕及晚孕不舒服、高血压、妊娠期水肿等情况，对刚怀孕的母亲会有心理上、生理上的各种不适挑战，情绪会受到一定波动，情绪不好也会影响免疫力，所以免疫力低。女性怀孕以后，营养物质会被胎儿分担一部分，每个脏器都要承担双份工作，除本身体循环，还要负担胎儿循 环，所以各个脏器负担都重，在这种情况下比未怀孕时免疫力低。