患者吃甲亢的药总胆红素偏高，要具体分析原因进行处理，具体如下：
1、如果患者在吃甲亢的药之前胆红素正常，吃甲亢药之后才出现升高，而且不合并有转氨酶的升高，要看胆红素升高水平有多少。如果总胆红素升高超过2.5倍以上，建议患者更换抗甲亢的药物，是由于胆红素特别高，防止出现胆汁淤积性肝衰竭；
2、如果患者合并有其他原因所导致的总胆红素升高，比如有胆囊结石、胆管结石，以及长期熬夜、其他的药物影响，患者可以先去除已知的原因进行护肝的治疗，再进行观察。观察一段时间之后，如果胆红素的升高还是不能够得到明显缓解，反而有升高的趋势，还是建议更换抗甲亢的药物，以 及进行消化系统的正规治疗；
3、如果患者吃甲亢药之前已经有胆红素的升高，吃药之后胆红素虽然偏高，但是也并没有明显的上涨趋势，可以考虑继续吃甲亢药物，同时加抗胆红素升高的药物、护肝的药物进行治疗。近期观察肝功能的变化、总胆红素的变化，以及转氨酶的变化，来决定下一步的治疗。
由于抗甲亢的药物或多或少会出现部分不良反应，如果在安全可控的范围是可以边用药进行对症的处理边观察。但是如果超出可以接受的范围，需要停药，或者是更换抗甲亢的药物进行治疗。