生理性的卵巢囊肿有可能自己消失，而病理性的卵巢囊肿不会消失，这也就是生理性和病理性卵巢囊肿的区别。
1、生理性卵巢囊肿：生理性的卵巢囊肿主要包括滤泡囊肿、黄体囊肿以及妊娠期出现的黄素化囊肿。前两种随着月经周期出现，分别出现在月经的前半期，也就是接近中期的前半期以及后半期。卵泡囊肿和黄体囊肿通常经过2-3个月会自行吸收，在2-3个月以后，月经后复查有可能就消失。而黄素化囊肿伴随着妊娠出现，通常出现在HCG比较高时，可以是双胎妊娠，也可以是葡萄胎以及侵蚀性葡萄胎，主要是由于HCG比较高所导致，在妊娠以后会逐渐自行消失；
2、病理性卵巢囊肿：其他囊肿比如畸胎瘤、卵巢浆液性囊肿、黏液性囊肿等，如果出现消失，很有可能是出现破裂。尤其是浆液性囊肿，如果发生破裂，通常会有急腹痛，B超发现囊肿不在。