支原体和梅毒相比较，应该是梅毒更难治，危害也更大。具体分析如下：
1、支原体感染：就性传播疾病而言，支原体感染可能与解脲支原体、生殖支原体等有关，引起非淋菌性尿道炎，主要的症状是引起尿道炎或者女性宫颈炎，还可以引起前列腺炎、精囊炎或者女性的子宫内膜炎、输卵管炎等，比较严重的是引起不孕不育。而治疗上是选择敏感的抗菌素，比如四环素类的米诺环素、多西环素或者红霉素类的阿奇霉素、克拉霉素，连服1-2周，支原体就可以控制。支原体感染也只局限于泌尿生殖系统，很少进入血液影响全身；
2、梅毒：梅毒是梅毒螺旋体感染引起的性传播疾病 ，与支原体感染不同，其可以进入血液，播散到全身各个脏器，影响皮肤黏膜还有某些内脏器官，比如心血管和神经系统都可以造成损伤。早期梅毒比较好治，使用长效青霉素肌肉注射，每周一次，3-4次即可治愈，但要定期复查，每3个月复查一次，直至滴度转阴才算治愈。梅毒造成内脏损伤，比如心血管梅毒、神经系统梅毒，治疗起来比较复杂。除驱梅治疗，还要针对器官损害对症治疗和支持治疗。