扁桃体在医学中根据分布不同部位包含有咽扁桃体、腭扁桃体、舌扁桃体等。日常所说的扁桃体多指的是腭扁桃体。它位于口咽腔，左右各有一个，位于咽部黏膜所围成的扁桃体窝之中，是人体非常重要的免疫器官。
一般在儿童期，尤其是在6-7岁的时候，扁桃体内的淋巴组织会增生，功能活跃，向体内提供免疫物质抵抗外界细菌及病毒的侵犯，这时腭扁桃体可出现生理性肥大。所以在幼年时，扁桃体对人体起着非常重要的保护作用。建议尽量保留，除非过度肥大或是反复感染而影响儿童生长发育，才考虑进行手术切除。
随着年龄增长，人体免疫系统不断得到完善，腭扁桃体在成年以后开始逐渐退化、萎缩。如果腭扁桃体还反复经常发生炎症感染，有可能会形成病灶，从而诱发急性心肌炎、肾炎或者风湿热，需要考虑进行手术予以切除。