临床上80％以上的甲亢都是弥漫性毒性甲状腺肿伴甲亢，即Graves病，是甲状腺自身免疫性疾病，多数可以完全治愈，常用治疗方法包括药物治疗、手术治疗、放射性碘-131治疗。甲亢药物治疗可分为控制期、减量期和维持期，不同阶段抗甲亢药的用量和时间都不同，然而一些患者，包括非专业的医生对此并不了解，而是一成不变的使用最初的治疗剂量，导致药物性甲减。
他巴唑和丙硫氧嘧啶是治疗甲亢的两种基本药物，抗甲亢药物只可抑制甲状腺激素的合成，但对体内已经合成的甲状腺激素不起作用，也不能阻止甲状腺激素的释放，所以服药后不能很快起效，需要等1-2周，待甲状腺滤泡内储存的甲状腺激素被消耗，才能看见临床效果。不可以随便更换药物或治疗方案，更有部分患者随意中断药物治疗，使病情反复。
在抗甲亢药物未充分显效的早期初治阶段，可以通过服用β受体阻滞剂抑制交感神经的兴奋 性，缓解甲亢患者的症状。手术治疗和放射性碘治疗会遗留甲减并发症，为备选治疗方案，常需要筛选相应的适应症。总之，无论何种治疗方案，均有良好效果，大多数患者可以治愈。