肝糖原如果耗尽会发生低血糖，人体正常血糖主要是来源于食物，但白天可以进食东西，可保持血糖平稳，但夜间晚餐后到第二天吃早餐前有10个小时，或更长时间无能量的摄入，但血糖仍然可维持正常。由于肝脏会将白天储存的葡萄糖进行释放，给身体提供葡萄糖，此为肝糖原。
当肝糖原减少或者耗尽时，身体无法提供夜间葡萄糖，患者会出现夜间低血糖或空腹低血糖，严重时可能会导致昏迷或死亡。在临床工作中较常见为各种原因导致的肝硬化，或原发性肝癌的患者，均可以导致肝脏正常的解剖结构被破坏，因此糖原的储存也会大量减少。患者临 床表现为典型的空腹低血糖或发生昏迷，所以当肝糖原耗尽时，则明确患者肝功能较差，应及时到医院就诊。