艾滋病在临床症状和反应上，并无性别区别，即女性艾滋病，临床症状和其他男性相同。主要反应是发热、消瘦、腹泻，以及全身淋巴结肿大，同时伴有机会性感染和机会性肿瘤。机会性肿瘤，如淋巴瘤在结核病患者中发病率较高，某些少见肿瘤，如卡波西肉瘤较容易出现于艾滋病患者。
在发热、消瘦的同时，存在各种机会性感染，常见感染部位是呼吸道。呼吸道可以有结核菌感染而出现肺部结核，有隐球菌感染而出现肺部隐球菌病。其他真菌疾病，也会有肺部细菌、病毒感染，如巨细胞病毒性肺炎，以及各种细菌导致肺炎 。
有真菌、结核菌，以及病毒和细菌导致的中枢神经系统感染，以及特殊病原体如弓形虫等导致神经系统感染。全身其他部位感染，还包括泌尿系统、肠道病原菌感染。真菌可以导致真菌性食道炎，以及皮肤、黏膜感染。