任何手术均有风险，故胆结石手术也具有风险。胆结石包括胆囊结石与胆管结石，目前胆囊结石都是做腹腔镜微创手术治疗，具有创伤小、恢复快的特点，但是对于某些高龄、情况较差、生命体征不稳或者是心肺功能较差患者，其心脑血管意外、麻醉风险都会增加。另外，在手术过程中也可能会损伤胆管或者血管，出现一些并发症。
对于胆管结石患者通常使用ERCP治疗，其虽然属于微创手术，但仍有一定风险，比如术中胆道损伤、出血、穿孔，术后部分患者可能出现胰腺炎。总之，虽然胆结石手术有一定风险，但患者不能因为有风险而避免手术，因为不手术，危害会更大，而且手术并发症相对来说概率非常低。对于胆结石手术，尽量做到术中精细操作、术后严密观察，做到并发症的早发现、早治疗。