阿莫西林不是牙龈肿痛的首选药物，单纯使用阿莫西林的效果，不如单纯使用甲硝唑、替硝唑，更不如联合使用广谱抗生素和硝基咪唑类的药物。
通常口腔内感染很多都是厌氧菌感染，首选的是对厌氧菌明显有效的药物，如硝基咪唑类的甲硝唑、替硝唑、奥硝唑。此类抗生素对厌氧菌有比较好的抑制效果，克林霉素对厌氧菌有很好的效果。
但是口腔中也不仅有厌氧菌感染，可能还会有其他的细菌感染。所以，如果感染比较明显，可以用两种抗生素联用，如甲硝唑、替硝唑等窄谱抗生素，专门对厌氧菌有效的抗生素。
另外，再结合一种广谱抗生素一起使用， 比如头孢。同时，也可以用青霉素族药物，如阿莫西林和甲硝唑、替硝唑配合使用。或者用大环内酯类的药物，比如红霉素、阿奇霉素，也可以和抗厌氧菌的药物配合使用，这样效果比较好。