如果首次发现卵巢囊肿，比如B超提示囊肿，表面光滑、没有乳头，而且不大，比如<5cm，可以短时间观察2-3个月。如果是生理性囊肿，会自行消失，不需要干预。如果是病理性囊肿，比如囊肿持续存在或者长大，需要手术治疗。
大部分卵巢囊肿如果短时间不想手术、不太考虑恶性，也可以用药物，比如口服短效避孕药观察，部分囊肿会消失、缩小。如果是实在卵巢囊肿，还是选择手术治疗比较好，因为任何B超检查、CT检查或者MRI检查都不能确实定性，囊肿到底是良性还是恶性，尤其有症状或者囊肿短时间增大，不排除恶性，首选手术治疗。