治疗小儿久咳不愈，首先需要明确具体原因，一般有以下几种情况：
1、上气道咳嗽综合征：此类患者有痰，同时会有鼻塞、流鼻涕的情况，病程较久，考虑有细菌或者一些特殊病原菌感染。建议在给予抗菌药物的同时，做好鼻腔清洁，清理鼻腔分泌物，减少倒流，从而减轻咳嗽症状；
2、咳嗽变异性哮喘：此类患儿表现为反复咳嗽，且不太有痰，晚上症状咳嗽较多，一般在跑步运动、吸入冷空气后症状加剧。这类孩子在小时候可能有湿疹或者有过敏性鼻炎，建议给予抗哮喘治疗，吸入治疗或每天晚上服用白三烯受体调节剂类药物进行相应治疗。
除上述原因外，胃食管反流等也会导致久咳不愈，但不论是何种原因导致，都需要进行对应治疗，且处理方案有所不同。