肺炎衣原体阳性，如果是核酸检测阳性，说明在标本中有肺炎衣原体的存在，即存在肺炎衣原体的急性感染。呼吸道的肺炎衣原体急性感染时，感染者可以作为传染的源头传播肺炎衣原体的感染。肺炎衣原体的感染一般是通过呼吸道的飞沫传播，也可以通过污染的物品进行传播，传染性相对比较小。如果是在学校、密闭空间以及人员密集区域，可以引起小规模的流行。
如果肺炎衣原体的检测阳性是抗体阳性，是否具有传染性要根据具体情况分析。如果是IgM抗体阳性，抗体滴度≥1∶32或急性期较恢复期血清中IgM或IgG的抗体有4倍以上增高，说明是处于感染的急 性期，具有传染性。但如果是IgG抗体阳性，而抗体的滴度又没有明显的改变，通常是处于感染的恢复期，不具有传染性。