巴氏腺囊肿是由于巴氏腺腺管被堵塞，使得巴氏腺分泌的一些液体不能够排出而聚集，形成了巴氏腺囊肿。巴氏腺又叫前庭大腺，位于大阴唇下方，开口于小阴唇内侧而接近处女膜的地方。由于其特殊的解剖关系，再加上同房、分娩等，特别容易受到一些病原菌侵犯而发生感染，感染以后就会形成脓肿。
有的病人会出现巴氏腺肿大、疼痛，伴有发烧。经过抗感染治疗以后脓肿好转，变成一个清亮的液体，形成了巴氏腺囊肿。一般情况下巴氏腺囊肿如果不大，病人没有症状，可以暂时不做处理。如果发现巴氏腺囊肿变大了，伴有一些症状，也可以进行手术治疗，包括巴氏腺囊肿剥除术或者是囊肿造口术等。