患者肝脓肿复发后，需采取抗生素治疗，必要时进行穿刺引流以及外科手术引流，或者切除病变的肝脏。肝脓肿是由于细菌感染在肝脏局部形成的坏死病灶，内部可以存在单个大脓肿的脓腔，或由多发的小脓肿融合而成，也可以表现为肝脏的蜂窝样脓肿。多数肝脓肿患者在初次治疗后，若原发病因未持续存在，细菌完全被清除，通常不会复发。但糖尿病患者的自身免疫功能较差，或者合并胆道梗阻性的疾病，可能会出现脓肿复发。
患者脓肿复发后还会出现与初始的肝脓肿相同的症状，表现为疼痛、发热及全身乏力。对于此类患者需通过影像学检查判断脓肿的大小及具体位置，通过血常规明确感染的严重程度，并抽取细菌培养以选择合适的抗生素。若通过药物治疗效果不佳，则需要进行脓肿的穿刺引流，必要时通过外科手术将脓肿以及周围受累的肝脏一并切除。