鼻腔和口腔的交界处出现疼痛，主要是由于鼻咽部黏膜出现炎症所导致。鼻腔和口咽部交界处即鼻咽部，是鼻腔和咽腔的连接处，如果患有慢性鼻炎，鼻涕不能从鼻腔内流出，导致鼻涕倒流污染鼻咽部黏膜，从而出现鼻咽炎，此时则可导致鼻咽部出现干疼或鼻后滴漏综合征。而分泌物也可通过鼻咽部流到咽腔内，刺激咽喉黏膜出现慢性咽炎的情况。
因此，如果患者鼻咽部出现疼痛，通常是由于慢性鼻炎或鼻窦炎导致分泌物出现鼻后滴漏综合征，而分泌物可污染鼻咽部，进而导致鼻咽部黏膜发炎，出现疼痛等不适感觉，此时可通过治疗原发病有效地 控制炎症。