肠系膜上动脉的栓塞，主要治疗方法是外科手术取出肠系膜上动脉里面的栓子，保证肠道血运供应的改善，这是主要治疗方法。因为肠系膜上动脉栓塞以后会引起缺血性肠病，导致肠管血运障碍，血运障碍以后肠管缺血就会导致肠坏死的表现，所以肠系膜上动脉栓塞是严重的疾病，要及时治疗。如果这时出现栓塞，要及时做手术把栓子给取出，同时也要积极地给予内科治疗，比如补液、扩容、抗凝治疗，维持患者的水电解质平衡、抗感染治疗，保证患者缺血性肠病得到有效恢复。
肠系膜上动脉栓塞以后，如果得到及时取栓，对患者非常有益。有一篇研究发现，肠系膜上动脉栓塞以后要及 早取出栓子，一般在12-16小时以内取出栓子，患者可以避免切除坏死的肠段，或者是切除坏死肠段的范围减少。所以一旦有肠系膜上动脉栓塞时，要尽可能给予手术取出栓子，改善患者肠道血运功能。