对大部分女性而言，发生一次自然流产后，第二次怀孕的风险较小，研究显示发生一次自然流产后，即便不进行任何干预治疗，大部分女性第二次怀孕也是可以正常分娩。对于不存在导致自然流产高风险因素的女性，包括体重过轻或过重、高血压、糖尿病、吸烟、酗酒，发生一次自然流产后，可以积极进行第二次备孕。如果第二次怀孕仍然发生自然流产或胚胎停育，此时应进行系统检查。
女性首先应对流产的胚胎组织进行染色体检测，对于大部分的自然流产而言，胚胎染色体异常所占的比例较高，其次当胚胎染色体检测未发现异常时，再进行其他导致流产高风险因素的排查，如是否存在子宫解剖结构异常、子宫肌瘤、子宫腺肌病、纵隔子宫，也可以导致自然流产的风险增加，其他的包括免疫系统紊乱、抗磷脂综合征、结缔组织病，以及是否存在内分泌紊乱。因此如果想明确自然流产原因， 应进行系统、全面排查，再进行针对性干预治疗，降低再次妊娠发生自然流产的风险。