小脑萎缩目前其实没有什么特效的药物治疗，主要针对其不同的病因，采用对症治疗。常用的药物主要是营养脑细胞的药物如艾地苯醌、辅酶Q10、丁苯酞，这些药物可以增加腺体的功能，对于治疗小脑萎缩有效。
还有部分小脑萎缩是由于血管病的危险因素引起，对于这类患者可以给予活血的药物，常用的药物有胞二磷胆碱、尼麦角林等。加用这些药物可改善供血，对小脑萎缩有效。
还要加用预防缺血性脑血管病的药物，如阿司匹林、他汀类药物控制血压都是比较有效的。总之，小脑萎缩目前治疗是比较棘手的，没有特别的有效的药物，主要是对症治疗。