子宫小怀孕的相关的危害，需根据原因而定，具体如下：
1、先天因素：如染色体异常、基因异常等；
2、子宫发育障碍：染色体和基因检查没有任何问题，出现子宫发育上障碍，比如始基子宫，没有子宫内膜，将会出现不规律的月经来潮，也有可能导致没有办法受孕。幼稚子宫需要给予相应的激素，促进子宫和子宫内膜发育。如果不加以处理，也有可能导致不孕症、早期妊娠发生频繁流产等；
3、个体差异：正常情况下，月经周期、月经持续时间、月经量以及周期性排卵监测都没有任何问题，不一定会导致排卵之后受孕困难、严重的不良妊娠结局。子宫大小属于较小范畴之内，在受孕之后伴随胎儿逐渐增大、羊水逐渐增多，可增加先兆流产、早产的风险。