生长激素是垂体产生，因此缺生长激素与垂体相关。患者多数为继发性起病，如垂体肿瘤、垂体外伤、脑外科手术，或者因为其他部位肿瘤必须做放疗、化疗，导致垂体受损，引起生长激素继发性缺乏。
有些患者天生生长激素缺乏，与垂体也有关，部分患者为先天性垂体发育不良，不仅缺生长激素，垂体产生的其它激素也缺，如促甲状腺激素、肾上腺皮质激素。如果为孤立性生长激素缺乏，多数与患者自身基因有关，即基因缺陷导致生长激素合成障碍。
严重的生长激素缺乏较少见，真正的生长激素缺乏称为垂体性侏儒，即矮小症。与甲状腺激素缺乏引起的呆小症不同，生长激素缺乏引起的个子矮不影响智力，不像甲状腺激素缺乏引起的呆小症，会影响智力。因此需要通过影像学检查判断垂体有没有问题，此外，也要通过激发试验检查生长激素是否缺乏。