小孩得了根尖周脓肿后，可能会影响后继恒牙的牙胚，使恒牙釉质发育不全，如特纳牙的发生。乳牙根尖周炎也会导致局部牙槽骨的破坏、根管感染以及牙根异常吸收，同时也会造成残根滞留，使后继恒牙的萌出过早或过迟，影响恒牙的萌出顺序和位置。
牙冠因龋缺损，也会造成近、远、中径的减少，会使后继恒牙所占的间隙缩小。后继恒牙萌出的时候，可能会因为间隙不足而发生位置异常。
乳牙龋蚀、牙体崩坏可以使食物残渣软垢等容易停留在口腔内，造成口腔卫生恶化，新萌出的恒牙容易发生龋蚀，同时也会影响患儿的咀嚼功能，造成儿童营养摄入障碍，同时影响颌面部和全身生长发育， 造成机体抵抗力下降。
病灶牙也会使机体其它组织发生病灶感染，与儿童有关的病灶感染有风湿性关节炎、蛛网膜炎、肾炎等。