患者肛瘘挂线术后，挂线期间分泌物比较多。挂线主要是慢性切割括约肌，以及引流出瘘管内的脏东西，因此会有较多的比较臭的分泌物流出。20天患者拆线以后，创口生长比较快，填充肉芽开始爬皮，因此拆线后，患者可能有1-2周还会存在分泌物。在完全爬皮以前都会存在分泌物，因此分泌物的持续时间大概得4-6周，患者不必紧张、害怕。
分泌物是比较正常的东西，挂线时分泌较多，但拆线后分泌物会越来越少，随着创口愈合、爬皮增进，分泌物会逐渐减少，直到封口以后，分泌物会逐渐消失。但是有时伤口刚完全愈合，可能存在瘢痕沟，部分患者会有肠液流出，待瘢痕软化 ，肛门闭合后，肠液不会再流出。