肝癌晚期患者有远处转移、已经侵犯门静脉或者血管，或者整个肝脏都有转移，一般无法手术。由于现在的技术发展还有科学水平，对肝脏肿瘤认识水平的提高，部分门静脉癌栓或者远处脏器的转移，可以切除肝脏原发病灶，同时可以切除转移的肿瘤。
如果有严重的肝功能失代偿期或者凝血功能障碍、大量腹水，属于手术禁忌症。心、肺、肾等脏器功能障碍无法耐受手术的患者也是手术的禁忌症，晚期肝癌需要分析具体情况。晚期肿瘤无法手术者，可以采取其它治疗方法，包括中医中药、放化疗，主要是肝动脉灌注化疗栓塞或者射频，有些报道大的肝癌或者其它地方有转移的患者、肺上转移者，对于局部肿瘤可以进行射频消融，达到治疗的目的。