在临床上，薄芝糖肽注射液主要是用来治疗进行性的肌营养不良、萎缩性的肌强直、前庭功能障碍、高血压所引起的眩晕、植物神经紊乱、癫痫以及失眠等疾病或者症状，还可以用来辅助治疗肝炎以及肿瘤。
薄芝糖肽注射液是处方药，它的应用一定要在医院，经过医生的规范诊疗后，在医生的处方或者医嘱的指导下才适合应用的注射用药，注射用药一般都是在医院内部应用。
一般来说，在医生的指导下来决定是否适合用这个药，在药师的指导下来告知药物的使用，如药物相互作用、注意事项、不良反应、用药禁忌等，应该在药师的指导和用药监护下来进行。