小肠镜检查实际上主要是小肠疾病检查，还有疾病随诊，以及少数息肉等疾病治疗。患者做小肠镜检查原因具体如下：
1、不明原因消化道出血，胃镜、肠镜均查不到原因，怀疑小肠疾病或者不明原因缺铁性贫血；
2、怀疑小肠肿瘤或者息肉等增生性疾病；
3、小肠克罗恩病，不管是检查还是治疗后随访，均需做小肠镜；
4、其他器械检查，比如做肠镜、X线、CT、核磁等，怀疑小肠存在病变时，需做小肠镜；
5、不明原因腹泻或蛋白丢失性肠病时，需做小肠镜；
6、不明原因小肠梗阻及外科手术后出现肠道病变，如有出血、梗阻，可做小肠镜进一步检查， 明确问题具体部位；
7、胃镜、肠镜无法解决，怀疑小肠病变情况，可在小肠镜下治疗。