G6PD缺乏症可以进行治疗和预防，但无法完全治愈，因属于体内红细胞酶缺乏所致，为基因性先天性疾病。如果出生后发生G6PD缺乏症，一般为终身性疾病，不可随年龄增大而自行缓解。但急性发作时可以进行治疗，平常生活中可以进行预防性处理，避免G6PD缺乏症出现。
产生严重并发症时可以进行处理，如出现明显黄疸、贫血等需要及时降黄疸或适当进行血液补充，改善贫血状态，且平常生活中需避免进食或触碰蚕豆或蚕豆类食物。此外，部分药物可引起G6PD缺乏症发作，如阿司匹林类药物，在儿童使用药物时，需要注意告知医生儿童存在G6PD缺乏症，此时需回避 部分可能引发G6PD缺乏症发作药物，以保证儿童健康成长。