会厌囊肿手术时间不会太长，根据囊肿多少和大小而定，通常10-50分钟。此手术是中等手术，在全麻支撑喉镜下操作。用激光或电刀切除会厌囊肿囊壁，吸净囊液，然后剥离或完整切除会厌囊肿囊壁。
病人从进手术室到出手术室，大约1-1.5小时，最长2小时左右。医院已经实行加速康复外科理念，所以住院时间明显缩短。在医院住院准备中心预约检查，先抽血，然后用1-2天时间做好全身检查，包括心肺功能、凝血、全身情况。
检查后第2天或第3天做手术，手术后恢复1-2天.根据患者愈合及全身情况，一共住院4-5天即可以出院。如患者出现其它症状，应相应延长住院时间，所 以视情况而定。