肛周脓肿是肛管里肛窦发生炎症，蔓延到肛肠腺，出现肛肠腺炎症，炎症逐渐加重，形成肛周脓肿。如果是表浅脓肿，经过肛周脓肿手术后，大部分患者不会出现复发，术后1年之内没有再次出现肿胀，说明完全治愈。部分患者在肛周脓肿初期，出现肛门周围疼痛，经过保守治疗疼痛消失，逐渐缓解治愈，但可能会出现复发。如果在2-3年内没有复发，可以认为肛周脓肿保守治疗治愈。
治疗肛周脓肿，主要在手术中找到感染的肛肠腺，把感染肛肠腺去除，把瘘管切开，使肛周脓肿达到完全治愈。人体肛管内有7-8个肛窦，相应连接肛肠腺，因此，某 部位的肛周脓肿治愈后，其他部位肛肠腺也可能会再发生脓肿。发生脓肿的患者是因肛窦较肥大，肛肠腺分泌较旺盛，容易出现感染。肛周脓肿形成初期，脓液较少，大概在2-3天后，脓液会较多，大部分患者需要手术治疗。