小肚子疼痛用药要根据病因和症状选择，常见原因及所需药物如下：
1、肠功能紊乱：表现为间断性的腹痛、腹胀，可以服用调节肠功能紊乱的药物，比如得舒特(匹维溴铵片)、援生力维(马来酸曲美布汀片)、乐健素(复方枸橼酸阿尔维林软胶囊)等。另外可以补充益生菌纠正肠道菌群的失调，如乳酸杆菌、思连康(双歧杆菌四联活菌片)等，经过上述药物调理，一般1-2个月即可缓解；
2、肠道炎症：若经上述调理后症状未缓解，应及时到医院就诊，可能需要做结肠镜，明确大肠内有无病变，比如溃疡性结肠炎，若有，需要口服美沙拉嗪或者局部肛门塞美沙拉嗪栓剂等治疗。
如果有其他疼痛，要根据不同的病变来做相应的治疗。