结核杆菌DNA阴性是指患者的体液中，检测的结核杆菌DNA没有超过正常的区间，即＜500copies/mL。检测结果为阴性，应结合其他的临床症状进行分析，从而判断患者是否被结核杆菌感染。因为结核杆菌DNA检测阴性，不一定预示着体内没有结核菌存在，仅提示低于正常的检测值。
一旦体内存在微量的结核菌感染，结核杆菌可在短时间内进行繁殖，此时再次检测结核杆菌的DNA可能呈现阳性。所以应结合临床症状以及其他检测指标进行分析，必要时需要复查结核杆菌，此时才能确定患者是否感染结核杆菌。若患者确诊结核杆菌感染，需要进行抗结核治疗。