心脏黏液瘤的手术时间，比复杂的心脏搭桥或者换瓣手术时间要短，平均在1-2个小时，主要是从开胸到关胸的时间，通常接近2个小时。但是从家属、患者的角度而言，整个手术时间，即从推到手术室，到从恢复室出来，可能需要3-4个小时或者更长时间。但是实际上黏液瘤的手术并不是特别复杂，手术本身所需时间可能是1-2个小时。
而每个患者的黏液瘤大小、具体生长部位不同，所以手术时间长短以及难易程度不同。另外，部分患者的基础情况，比如心肺情况，以及胸廓是否做过手术、是否畸形，各种穿刺、置管等入路是否顺利建立等，对手术时间的影响都比较大。