根据世界卫生组织精液分析第5版的诊断标准，如果正常精子的百分比＜4%，可以诊断为畸形精子症。
很多病人看到报告上显示正常精子百分率只有1%、2%、3%时，都非常担心后续的治疗、子代的健康问题以及精子畸形率是否会影响到生育的结局。
现在所通行的世界卫生组织第5版的关于精子形态的标准比较严格，所以正常精子形态只要≥4%即可。正常形态的精子被认为是具有生命潜能的精子，因此正常形态的精子数量越多，受精的概率也就越高。
相反如果精子畸形率过高，比如部分患者只有1%、2%的正常精子，自然受孕的概率也会下降。
精子在产生和成熟期间会受到很多不良因素的影响，从而导致畸形率偏高，比如不良的生活习惯，包括抽烟、酗酒、经常熬夜，还有是内在原因，比如基因突变、常染色体异常以及Y染色体微缺失等遗传因素。
还有很多的原因是目前没有认识到的，在精子畸形率过高的情况下，受孕率会有一定程度的下降。