如果是由于遗传因素引起的复发性流产，比方夫妻双方染色体问题，或者上次流产的胎儿组织问题，可以通过试管婴儿的方法进行治疗，即第三代试管婴儿。指在体外获得胚胎之后，对一部分细胞进行检测，从而拿到正常的胚胎进行移植。针对染色体问题通常可以考虑采取试管婴儿的方法，在体外授精过程中取到胚胎，从胚胎上选取几个细胞进行检测。从而检测是否存在染色体问题，避免有染色体异常的胚胎再次妊娠，从根本上解决由于染色体问题导致的着床失败，或者复发性流产的发生。
复发性流产的病因非常复杂，目前常见的病因包括遗传因素、感染因素、解剖因素、凝血功能、免疫及其它因素。针对上述因素主要进行对因治疗，其中针对遗传因素，即染色体异常的治疗分为两种情况，偶发胚胎染色体异常多见于环境因素或女方高育龄。而复发性流产的治疗较为复杂，因为复发性流 产的病因较多，有的是由于遗传学因素引起，有的则是由于解剖、免疫、凝血、内分泌等其它因素引起。