儿童系统性红斑狼疮为多系统受累的疾病，早期起病特别隐匿，没有表现出症状。
患者可以皮疹起病，如患者早期会出现面部的皮疹。称为红斑狼疮的原因是患者脸上会出现蝶形红斑皮疹，该症状是比较典型的狼疮。
部分孩子会以血液系统受累为主要表现，早期表现为血小板减少，部分儿童因为出血点或漱口老出血前来就诊，检查发现患者血小板很低，再经过系统检查发现是儿童系统性红斑狼疮。
部分患者起病急，可能是以神经系统受累为主要表现，患者会出现抽搐、昏迷，最后检查发现是狼疮疾病。
部分儿童会以关节炎起病为主要表现，该类患者比较多，会出现关节肿胀、疼痛或活动受限，检查其血常规发现患者有贫血或C反应蛋白偏高，再继续检查会发现患者可能为狼疮疾病引起关节受累。
儿童系统性红斑狼疮早期症状特别不典型，部分孩子可能有低烧、没精神、乏力、食欲不好、体重下降等非特异症状，这时可以检查血常规，有经验的大夫根据血常规可以推测患者是否有问题。