病理性黄疸可根据临床表现和辅助检查进行病因诊断，常见的有以下几个方面：
以未结合胆红素增高为主：
1、新生儿血型不合性溶血，比如新生儿溶血病；
2、葡萄糖-6-磷酸脱氢酶缺乏症：在南方发病率较高，蚕豆、磺胺药、抗疟疾药、樟脑丸等为诱发因素；
3、感染性黄疸：如败血症、尿路感染、感染性肺炎等均可引起黄疸的加重；
4、其它包括头皮血肿、颅内出血、其它部位出血、窒息、药物，如磺胺药、青霉素等、红细胞增多症、胎粪排出延迟等均可引起黄疸。
以结合胆红素增高为主
1、新生儿肝炎：如甲型肝炎、乙型肝炎、巨细胞病毒肝炎、弓形虫病等；
2、胆汁淤积综合征：某些药物、静脉营养、败血症等可引起胆汁淤积；
3、胆道疾病：如先天性胆道闭锁、胆总管囊肿等。