临床上，三叉神经痛开颅手术顺利者，基本无严重后遗症。但手术若不顺利，可出现下列情况：
1、如分离过程中，因位置较深需通过岩静脉结构，则较难处理。岩静脉理论上可切除或结扎，但少数患者结扎岩静脉后，造成严重并发症，主要造成脑肿胀，目前手术已基本保留岩静脉；
2、头晕反应：一般术后3-5天，患者由于术后低颅压可导致头晕，通过平卧休息，适当活动，即可缓解；
3、颅内压增高、听力障碍或面瘫：发生几率通常不到1％；
4、脑脊液流失：手术导致头皮或骨孔封闭不全，可引起脑脊液漏，若脑脊液流失过多，可引起气颅或轻微疼痛；
5、炎症反应：比如引发发烧或头皮感染，需严格无菌操作避免；
6、临床中还可因手术医生经验不足，出现分辨错误，三叉神经痛，误认为是面神经或听神经的疾病，此类情况比较少见。