漏斗胸具体病因不明确，通常认为与下列因素有关：
1、膈肌中心腱短缩：膈肌中心腱缩短牵拉胸骨和肋软骨使之向后凹陷，从而形成漏斗胸畸形；
2、呼吸道阻塞：呼吸道存在阻塞的患者因吸气性呼吸困难而用力吸气，长时间可形成漏斗胸；
3、部分前方膈肌肌肉纤维化：部分前方膈肌肌肉纤维化而向后牵拉胸骨和下部分肋软骨，可能是造成漏斗胸的原因；
4、骨和软骨发育障碍：临床认为胸骨和肋软骨发育障碍可能是导致胸骨和肋软骨生物力学功能下降，在呼吸肌作用下，生物力学性能下降的胸骨和肋软骨就会向后方凹陷，从而形成漏斗胸畸形；
5、结缔组织异常：漏斗胸常合并骨骼肌肉系统 疾病，如脊柱侧弯、先天性髋关节脱位、脊柱后凸，提示漏斗胸形成可能与结缔组织异常有一定的关系；
6、遗传因素：约15%-40%的漏斗胸患者具有家族遗传病史。