过氧化物酶抗体是针对甲状腺过氧化物酶的抗体，过氧化物酶又是甲状腺合成甲状腺素过程中较关键的酶。如果身体出现上述酶抗体，抗体会和酶相结合，降低酶活性。出现甲状腺过氧化物酶抗体时，甲状腺过氧化物酶活性下降，甲状腺素合成受到影响，患者通常可出现甲状腺功能减退。
临床工作中桥本甲状腺炎的特点即为甲状腺过氧化物酶以及甲状腺球蛋白抗体增高。因此桥本甲状腺炎患者，随病程迁延易出现甲状腺功能减退。目前针对甲状腺过氧化物酶抗体，还没有效果较好特效药将其转阴。因此对于抗过氧化物酶抗体增高患者，一般采取动态观察，如果甲状腺功能正常定期复查即可，不用特殊处理。