麻痹性斜视的患者，首先要通过检查来确定麻痹眼和麻痹肌肉以及神经，然后再做检查来寻找原因，如有没有外伤、有没有周围炎症、有没有眼眶和脑部肿瘤、有没有全身的病，如糖尿病、甲状腺疾病等，然后选择对症治疗。但是如果没有原因的麻痹性斜视，首先要选择激素和抗生素的治疗，还可以口服或肌注维生素B1、B12和三磷酸腺苷等支持治疗来营养神经。
在治疗过程中，一般要遮盖一只眼睛，防止复视的困扰，但是遮盖的时候要两个眼交替遮盖，预防视功能的下降。但是中医方面一般采用中药的对症治疗以及针灸和按摩治疗，针灸也就选择眼睛局部的穴位，如睛明、承泣、太阳、鱼腰、攒竹、四白合并全身穴位，百会、合谷，还有肝俞、脾俞、肾俞等。还可进行局部按摩，也就是眼睛周围的穴位按摩来进行治疗，临床效果比较好。