黏液腺囊肿现在一般常规使用的方式是手术治疗，手术时机是不要等到囊肿破溃的时候，我们可以看到囊肿像一个葡萄一样晶莹透亮的隆起。
这个时候对医生做手术的指导有很大帮助。我们手术是要切除囊肿，同时要切除与囊肿关联的腺体，这样能够有效的根治黏液腺囊肿。如果手术当中不把关联的腺体摘除，囊肿有可能还会复发。如果伤及相邻的黏液腺，同样也可能会发生囊肿复发。所以做这样的手术虽然非常小，但是医生需要有丰富的临床经验。
手术过程中病人不会有很多痛苦，而且也不会有很多出血。一个手术大概十几分钟可以结束。手术以后病人注意饮食结构，注意遵从医嘱，一般不会有很大变化，而且手术都比较顺利。