消化不良包括功能性消化不良和器质性消化不良，常见诊断方法如下：
1、功能性消化不良：指各种检查没有发现明确疾病，只是单纯有一些症状，如早饱、腹胀等症状，将诊断为功能性消化不良。对于功能性消化不良的诊断，根据患者只是单纯的消化不良症状，而没有其他报警症状，即没有明显纳差、消瘦、贫血等不良症状。同时完善检查，如腹部B超检查，未发现疑难疾病，行胃肠镜检查基本在正常范围之内，即可诊断功能性消化不良；
2、器质性消化不良：其他疾病引起的消化不良症状，如B超检查时发现存在胆囊结石，引起消化不良 ，则属于器质性消化不良。同样胰腺疾病，如胰腺癌或者慢性胰腺炎，也可以引起消化不良，可能需行腹部B超以及腹部CT检查，才能发现胰腺占位。
此外，消化不良除胃肠道、消化系统疾病外，全身性疾病也可以引起消化不良。如患者存在糖尿病，血糖控制不佳，存在肾功能不全，并没有进行较好治疗，均可能导致消化不良症状，出现腹胀、纳差。此时需要治疗全身性疾病，才能改善消化不良症状。