一般恶性卵巢畸胎瘤患者在早期并无症状，多数患者是通过妇科检查或超声检查偶然发现，也有部分患者由于发生卵巢恶性畸胎瘤的蒂扭转或畸胎瘤破裂、出血、感染等并发症而发现。在出现这些并发症时，通常会出现急性腹痛，同时伴有恶心、呕吐、发热、休克等症状。
恶性畸胎瘤晚期，患者会出现消瘦、体重明显减轻、贫血等恶病质表现。当腹部的包块迅速增大时，即腹水出现，患者会出现腹胀、恶心、食欲减退等消化道症状。还有部分患者可能会出现胸闷、憋喘、不能平卧等症状。如果肿瘤压迫或蔓延至周围的组织或器官，则可能会引起腹痛、腰骶部坠痛、下肢疼痛、 便秘、排便困难及尿潴留等症状。
畸胎瘤形成后不会自动消失，也没有任何药物可以有效治疗，患者一定要积极配合医生尽快行手术治疗，因为有的畸胎瘤可能会发生恶变，形成恶性畸胎瘤。