新生儿血小板减少的原因可以分为免疫性、感染性、遗传性以及无法明确分类的。免疫性里面，包括同种免疫性血小板减少，就是妈妈和小孩的血小板抗原不一样，因为宝宝身上有一半的基因来源于爸爸，宝宝抗原性，就是身体免疫特性一定跟妈妈不同，有一些会引起同种免疫性血小板减少，就是血小板被破坏。
第二个是免疫性因素里面，先天性被动性血小板减少，就是妈妈有特发性血小板减少，宝宝也同样会有。因为这种情况下就是妈妈体内可能会有一些因素影响到血小板寿命。
还有就是药物所致新生儿血小板减少，有些药物吃进去引起血小板减少，还有就是溶血合并血小板减少。
感染 比较常见的是先天性感染，如遗传性或者硬肿症、红细胞增多症、巨大血管瘤、坏死性小肠结肠炎，都有可能导致血小板减少，血小板减少的原因非常复杂，还是要查明原因。