子宫内膜异位症的治疗分为药物和手术两种方法，需要进行手术治疗的患者如下：
1、如果症状、体征都提示有子宫内膜异位症的病灶，同时临床表现为继发性痛经进行性的加重，或者性交的深部疼痛，阴道后穹窿有触动性的结节；
2、B超或者磁共振的检查发现有明确的子宫异位病灶，且范围比较大的情况下；
3、当阴道B超提示卵巢巧克力囊肿的直径过大，超过4公分以上；
4、不能够排除巧克力囊肿恶变可能，或者是多发囊肿；
5、如果合并不孕症的患者，或者药物治疗不理想，且症状比较明显的患者；
6、当输卵管有梗阻或者肠管狭窄，考虑是异位病灶引起的患者。